Dengan fitur Y-Connect, pengendara bisa memantau kondisi kendaraan secara realtime melalui smartphone. Selebihnya, fitur keduanya tetap sama.
Misalnya seperti start stop system (SSS), soket pengisian daya ponsel, gantungan ganda, pijakan kaki anak, lampu LED, handle besi tambahan di belakang dan bagasi lega dengan kapasitas 18 liter.
Sementara untuk bagian mesin kedua versi Yamaha Gear Ultima 125 Hybrid tak berbeda. Baik Standard dan S Version sama-sama menggunakan mesin BlueCore 'Hybrid' dengan kapasitas 125cc dan pendingin udara.